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NovaSeq 6000
先进的应用是获得重大发现的关键
NovaSeq 6000通过先进的应用提供更深更广泛的覆盖,可获得基因组的全面视图。利用高通量测序解锁遗传变异和生物学功能。
简化灵活的工作流程旨在帮你加快研究速度并得到高质量研究成果。
管理工作流程 | 制备文库 | 测序 | 数据分析 | 解读结果 |
使用BaseSpace Clarity LIMS或您现有的LIMS系统来无缝管理工作流程 | 使用一系列高性能文库制备试剂盒来制备文库 | 使用带有成熟的illumina边合成边测序功能的即用型试剂进行测序 | 利用illumina DRAGEN Blo-IT平台或BaseSpace Sequance Hub进行准确快速的二级分析 | 使用BaseSpace Variant Interpreter、BaseSpace Cohort Analyzer和TruSight软件套装来解读结果,深入了解并不断发现 |
主要应用和方法
全基因组测序
NovaSeq可更经济高效地开展全基因组测序。使用简单的一体化、自动化工作流程,在双流动槽模式可下生成高达6 Tb和200亿条read的可扩展产出。该系统可在1天内对一组3个样本进行测序,也可在2天左右的时间里对多达48个基因组进行测序,以实现更全面的覆盖。
文库制备 | 测序 | 分析 |
3-5h | ≤44h | <25min(每个样本的分析时间,假设200x覆盖度/样本) |
Illumina DNA PCR-Free Prep高性能、快速、集成的工作流程,适用于人类全基因组测序或肿瘤-正常测序等灵敏应用。 llumina DNA Prep快速、集成的工作流程,适合广泛的应用,从人类全基因组测序到扩增子、质粒和各种微生物。 | NovaSeq Reagent Kits v1.5新款试剂盒拥有升级的试剂配方、更长的保质期(2倍)和更低的测序成本,为您的研究提供强大动力。 | DRAGEN Germline Pipeline(BSSH或DRAGEN服务器上)DRAGEN Germline Pipeline v3可进行比对和选择性变异检出,可输入FASTQ文件,输出BAM和VCF文件(可同时输出两种格式的文件)。 DRAGEN Somatic Pipeline(BSSH或DRAGEN服务器上)DRAGEN Somatic Pipeline可进行比对和变异检出,可输入仅肿瘤或肿瘤/正常FASTQ文件,输出BAM和VCF文件。 |
全外显子组测序
WES只检测不到2%的基因组,是一种比WGS更经济实惠的选择。NovaSeq系统使用双S4流动槽,单次运行可提供多达500个外显子组的测序。
文库制备 | 测序 | 分析 |
6h(总制备时间2.5天,手动操作时间6小时) | ~25h | <8min(每个样本的分析时间,假设100x覆盖度/样本) |
Illumina DNA Prep with Enrichment此试剂盒采用了快速且用户友好的工作流程。On-Bead Tagmentation测序化学技术结合了简化的单一杂交实验方案,缩短了整个工作流程所用的时间。 | NovaSeq Reagent Kits v1.5新款试剂盒拥有升级的试剂配方、更长的保质期(2倍)和更低的测序成本,为您的研究提供强大动力。 | DRAGEN Enrichment此应用程序可进行比对和选择性变异检出,可输入FASTQ,BAM或CRAM文件,输出BAM和VCF文件(可同时输出两种格式的文件)。 |
全转录组测序
在普通或低质量样本中发现编码RNA和多种形式的非编码RNA。借助NovaSeq系统,您可以使用双S4流动槽在单次运行中对多达400个转录组进行测序。
文库制备 | 测序 | 分析 |
<7h | ~25h | <15min(每个样本的分析时间,假设200x覆盖度/样本) |
Illumina Stranded Total RNA Prep使用多种样本快速制备文库,以极大的灵活性研究编码和非编码转录组。 | NovaSeq Reagent Kits v1.5新款试剂盒拥有升级的试剂配方、更长的保质期(2倍)和更低的测序成本,为您的研究提供强大动力。 | DRAGEN RNA Pipeline进行比对、定量和融合检测。 |
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